Para un estudio, los investigadores buscaron identificar los procesos moleculares que causan la resistencia a la terapia endocrina (ETR) mediante una investigación genómica exhaustiva de los tumores de mama. Las muestras tumorales antes y después del tratamiento de 35 pacientes con cáncer de mama con receptor de estrógeno positivo que recibieron terapia endocrina neoadyuvante y adyuvante revelaron que 3 desarrollaron resistencia intrínseca, 19 adquirieron resistencia y 13 permanecieron susceptibles. Se utilizaron los cambios neoadyuvantes en el volumen del tumor y la vigilancia de la recurrencia adyuvante para evaluar la respuesta. Alrededor de 12 pacientes recibieron terapia endocrina dos veces o más, y la segunda ronda comenzó después de que se determinó que la primera period ineficaz. La secuenciación del ADN del exoma completo y la secuenciación del ARN se realizaron en todas las muestras, que comprenden 169 especímenes únicos. Las mutaciones de ADN, las alteraciones del número de copias y los datos de expresión génica se examinaron mediante algoritmos supervisados y no supervisados para identificar las características moleculares relacionadas con la ETR. Las alteraciones que se presentaron con mayor frecuencia en ETR fueron las de GATA3 y ESR1. Se encontró la conocida variante ESR1 D538G que causa ETR y la mutación poco común E380Q que causa hipersensibilidad endocrina. Los tumores que desarrollan resistencia mostraron perfiles de expresión génica distintos de los tumores malignos sensibles y estaban más enriquecidos en las vías de señalización ER, HER2, GATA3, AKT, RAS y p63. Los datos de cada paciente se examinaron cuidadosamente, mostrando la gama de técnicas de ETR. Debido a que la ETR tiene una variedad de mecanismos subyacentes y diversos cambios en los perfiles genéticos somáticos y transcriptómicos que los caracterizan, será necesario desarrollar una estrategia individualizada utilizando biomarcadores genómicos y genéticos y medicamentos adaptados a cada paciente para superar la resistencia.
Fuente:
https://aacrjournals.org/clincancerres/article/28/16/3618/707400/Integrated-DNA-and-RNA-Sequencing-Reveals-Drivers
