Investigadores identifican biomarcadores resistentes a la quimioterapia en el cáncer de mama triple negativo

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Los científicos utilizaron proteogenómica a microescala para analizar biopsias tumorales tomadas de pacientes con TNBC antes del tratamiento con quimioterapia combinada con carboplatino y docetaxel. Los datos de los enfoques estándar de secuenciación de ADN y ARN se integraron con análisis proteómicos y fosfoproteómicos basados ​​en espectrometría de masas para crear retratos moleculares completos de tumores que responden al tratamiento versus tumores resistentes al tratamiento (Descubrimiento del cáncer24 de agosto de 2022).


El análisis reveló vías metabólicas asociadas con la resistencia al tratamiento, incluido el metabolismo de los ácidos grasos. Al considerar juntos los datos de proteómica y expresión génica, los investigadores descubrieron que la sensibilidad a la quimioterapia estaba marcada por firmas de reparación de ADN más altas, señalización de interferón gamma y componentes de puntos de management inmunitarios. El descubrimiento sugiere que un predictor multiómico para la respuesta a la quimioterapia está al alcance, según el equipo del estudio.


Después de su descubrimiento, los investigadores triangularon la respuesta al tratamiento, la eliminación o ganancia cromosómica y las disminuciones o aumentos concordantes en la expresión de ARNm y proteínas. Encontraron una deleción en el cromosoma 19, ubicada en la región 19q13.31-33, asociada con la resistencia al tratamiento con quimioterapia. De los cientos de genes eliminados en esta ubicación, la expresión del gen LIG1 de la ADN ligasa fue uno de los genes suprimidos de manera más consistente tanto a nivel de ARNm como de proteína, encontraron.


Usando sistemas modelo y otros conjuntos de datos de TNBC, la pérdida de expresión y/o la eliminación de LIG1 se asoció con resistencia selectiva al carboplatino y un resultado clínico deficiente. También se asoció con un mal pronóstico en otros tipos de cáncer, lo que significa que la eliminación tiene un significado clínico más amplio.


Luego, el equipo del estudio está trabajando en ensayos de grado clínico para confirmar que la pérdida de LIG1 se puede usar de manera segura para dirigir la quimioterapia con carboplatino en TNBC.


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